Ngày 28/2, Cục Thuế TP Hà Nội công bố kết luận thanh tra thuế tại Công ty TNHH Du lịch, dịch vụ xây dựng Bảo Yến (Bảo Yến Group), trụ sở chính tại xã Nam Đồng, huyện Đông Anh.
Theo kết luận của Cục Thuế Hà Nội, Bảo Yến Group kê khai thiếu doanh thu thuế suất 10%, kê khai khấu trừ thuế giá trị gia tăng đối với các hóa đơn mua hàng hóa dịch vụ của doanh nghiệp không hoạt động tại địa chỉ đăng ký. Công ty vi phạm về xác định đối tượng chịu thuế suất 10% tại Điều 11; vi phạm về nguyên tắc, điều kiện khấu trừ thuế giá trị gia tăng đầu vào quy định tại Điều 14, Điều 15 Thông tư số 219 ngày 31/12/2013 của Bộ Tài chính; sửa đổi, bổ sung tại Điều 1 Thông tư số 26 ngày 27/2/2015 của Bộ Tài chính.
Về thuế thu nhập doanh nghiệp, công ty hạch toán chi phí đối với các hóa đơn mua hàng hóa dịch vụ của đơn vị đã có thông báo không hoạt động tại đại chỉ đã đăng ký, hạch toán chi phí lãi vay giao dịch liên kết vượt mức khống chế, hạch toán chi phí không đầy đủ hồ sơ và không phục vụ sản xuất kinh doanh…
Kết luận của cơ quan Thuế nêu công ty có tình tiết tăng nặng là khai sai, khai không đầy đủ các chỉ tiêu liên quan đến xác định nghĩa vụ thuế trong hồ sơ thuế nhưng không dẫn đến thiếu số tiền thuế phải nộp; hoặc không dẫn đến tăng số tiền thuế được miễn, giảm, hoàn của 8 kỳ kê khai thuế giá trị gia tăng tháng 2,3,4,5,6,7,8,9 năm 2023.
Về xử phạt hành chính, Bảo Yến Group bị phạt số tiền hơn 223,7 triệu đồng do có hành vi khai sai dẫn đến thiếu số tiền thuế phải nộp hoặc tăng số tiền thuế được miễn, giảm, hoàn theo quy định của Chính phủ, mức phạt 20% tính trên số thuế thiếu do khai sai.
Đồng thời, Công ty bị xử phạt số tiền 56,55 triệu đồng đối với hành vi khai sai, khai không đầy đủ các chỉ tiêu liên quan đến xác định nghĩa vụ thuế trong hồ sơ thuế nhưng không dẫn đến thiếu số tiền thuế phải nộp; hoặc không dẫn đến tăng số tiền thuế được miễn, giảm, hoàn theo quy định.
Cùng với đó, công ty bị xử phạt đối với hành vi lập hoá đơn không đúng thời điểm theo quy định số tiền 6 triệu đồng.
Về biện pháp khắc phục hậu quả, cơ quan truy thu thuế thu nhập doanh nghiệp tăng thêm qua thanh tra số tiền hơn 1,11 tỷ đồng (năm 2022 hơn 569,3 triệu đồng, năm 2023 hơn 549,2 triệu đồng).
Bảo Yến Group có tiền chậm nộp tiền thuế số tiền hơn 173,9 triệu đồng theo quy định, mức phạt 0,03%/ngày tính trên số thuế nộp chậm. Số tiền chậm nộp tiền thuế nêu trên được tính đến hết ngày 27/2/2025.
Cơ quan thuế yêu cầu Bảo Yến Group tự tính và nộp số tiền chậm nộp tiền thuế kể từ ngày 28/2/2025 đến ngày nộp đủ số tiền thuế chậm nộp vào ngân sách nhà nước. Ngoài ra, giảm thuế giá trị gia tăng còn được khấu trừ chuyển kỳ sau số tiền hơn 143,2 triệu đồng.
Như vậy, Bảo Yến Group phải nộp ngay số tiền thuế truy thu, tiền phạt vi phạm hành chính và tiền chậm nộp với tổng số tiền 1,57 tỷ đồng.
Hồ sơ về Công ty Bảo Yến
Theo tìm hiểu, Công ty TNHH Du lịch, dịch vụ xây dựng Bảo Yến thành lập ngày 15/4/2002. Sau hơn 20 năm hoạt động, doanh nghiệp đã tạo lập vị trí lớn trong lĩnh vực giao thông vận tải, chiếm lĩnh thị phần ở Hà Nội và một số tỉnh lân cận.
Ngoài các tuyến xe buýt trong nội đô, Công ty Bảo Yến còn cung cấp dịch vụ vận tải hành khách theo tuyến cố định, theo hợp đồng (chuyên chở tập thể, cá nhân đi thăm quan, du lịch bằng ô tô 4 - 45 chỗ), đưa đón nhân viên tại các khu công nghiệp (chủ yếu cung đường Hà Nội - Thái Nguyên), cho thuê xe tự lái...
Công ty Bảo Yến cũng thực hiện chiến lược Nam tiến, với ít nhất 3 tuyến xe buýt đang hàng ngày chở khách tại TP.HCM.
Trái lại sự nổi tiếng của thương hiệu Bảo Yến, giới chủ của doanh nghiệp vô cùng kín tiếng, hiếm lần xuất hiện chính thức trên truyền thông. Không nhiều người biết rằng, Công ty Bảo Yến được sáng lập và vận hành xuyên suốt bởi hai doanh nhân Nguyễn Anh Tuấn (sinh năm 1974) và Lê Thị Xuân (sinh năm 1975).
Ông Nguyễn Anh Tuấn và bà Lê Thị Xuân sở hữu tuyệt đối cổ phần của công ty Bảo Yến.
Trong giai đoạn 2017 - 2023 khi liên tiếp tăng số vốn điều lệ từ 35 tỷ đồng lên 310 tỷ đồng thì đây cũng là thời kỳ Bảo Yến trúng nhiều gói thầu cung cấp dịch vụ vận tải bằng xe buýt từ Trung tâm Quản lý giao thông công cộng TP Hà Nội, số tiền hợp đồng lên đến hàng nghìn tỷ đồng.
Hồi tháng 12/2021, công ty Bảo Yến gây xôn xao khi thắng đến 7 gói thầu tương ứng với 7 tuyến xe buýt có số hiệu từ 157 đến 163 trên địa bàn thành phố trong cùng một ngày. Là nhà thầu duy nhất nộp hồ sơ đăng ký, công ty Bảo Yến được lựa chọn là đơn vị thực hiện với tổng giá trị trúng thầu của 7 gói thầu là 1.050 tỷ đồng, chỉ giảm 254 triệu đồng so với giá gói thầu, tiết kiệm 0,02% cho nguồn vốn (sử dụng nguồn trợ giá từ TP Hà Nội và nguồn vốn xã hội hóa).
Trong giai đoạn 2018 - 2020, Công ty Bảo Yến cũng giành chiến thắng tuyệt đối với kịch bản tương tự tại Trung tâm Quản lý giao thông công cộng TP Hà Nội, với khối lượng là 6 gói thầu trị giá hơn 1.267 tỷ đồng.
