Quá trình điều tra vụ án, Cơ quan Cảnh sát điều tra Công an tỉnh Hưng Yên đã xác minh trong năm 2017, Trung tâm y tế huyện Mỹ Hào, tỉnh Hưng Yên đã cấp tổng cộng 612 giấy chứng nhận nghỉ việc, 1 giấy ra viện cho 467 người để hưởng chế độ BHXH. Trong đó, chủ yếu cấp cho công nhân của Công ty TNHH công nghiệp Brother Việt Nam có địa chỉ tại khu công nghiệp Phúc Điền, huyện Cẩm Giàng, tỉnh Hải Dương và Công ty TNHH sản xuất phụ tùng ô tô, xe máy Việt Nam địa chỉ tại thị trấn Như Quỳnh, huyện Văn Lâm, tỉnh Hưng Yên.
Các đối tượng đã dùng các chứng từ trên để thanh toán chế độ BHXH tại hai tỉnh là BHXH tỉnh Hưng Yên và BHXH tỉnh Hải Dương với tiền 540.869.300 đồng. Trong đó, Cơ quan Cảnh sát điều tra Công an tỉnh Hưng Yên đã xác định Trung tâm y tế huyện Mỹ Hào, tỉnh Hưng Yên đã cấp khống 500 giấy chứng nhận nghỉ việc và giấy ra viện (Nội dung khám, chữa bệnh thể hiện trên giấy tờ là không có thật). Cụ thể đã cấp cho 367 người, trong đó 74 người thuộc Công ty TNHH sản xuất phụ tùng ô tô, xe máy Việt Nam sử dụng 126 giấy chứng nhận nghỉ việc, giấy ra viện và 293 người thuộc Công ty TNHH công nghiệp Brother Việt Nam sử dụng 372 giấy chứng nhận nghỉ việc.
Căn cứ tài liệu điều tra, Cơ quan Cảnh sát điều tra Công an tỉnh Hưng Yên đã khởi tố bị can đối với 11 cán bộ thuộc Trung tâm Y tế huyện Mỹ Hào, tỉnh Hưng Yên gồm: Nguyễn Kim Hữu sinh năm 1957 - nguyên Giám đốc Trung tâm Y tế huyện Mỹ Hào; Lê Thị Kinh Oanh sinh năm 1970 - Phó giám đốc Trung tâm Y tế huyện Mỹ Hào; Nguyễn Quốc Tuấn sinh năm 1960 - Trưởng khoa Ngoại, Trung tâm y tế huyện Mỹ Hào; Phạm Thị Thúy sinh năm 1987 y tá hành chính khoa Ngoại, Trung tâm Y tế huyện Mỹ Hào; Vũ Ngọc Thắng sinh năm 1967 bác sỹ khoa Đông y, trú tại thôn Trại, xã Dị Sử, huyện Mỹ Hào, tỉnh Hưng Yên; Lưu Thị Hoa Liên sinh năm 1967 Phó khoa nội Nhi, trú thôn Ngọc Lâm, xã Phùng Chí Kiên, huyện Mỹ Hào, tỉnh Hưng Yên; Nguyễn Thị Minh Hậu sinh năm 1977 Phó khoa cận Lâm Sàng, trú tại thôn Thợ, xã Dị Sử, huyện Mỹ Hào, tỉnh Hưng Yên. Nguyễn Thị Liên sinh năm 1983 nữ hộ sinh, trú thôn Tú Mỹ, xã Phùng Chí Kiên huyện Mỹ Hào, Hưng Yên. Phạm Thị Hường sinh năm 1963 nguyên Điều dưỡng trưởng khoa khám bệnh, trú thôn Đào Du, xã Phùng Chí Kiên, huyện Mỹ Hào tỉnh Hưng Yên. Cao Thị Dung sinh năm 1984 trú thôn Ngo, xã Bạch Sam, huyện Mỹ Hào, tỉnh Hưng Yên, nghề nghiệp Điều dưỡng trưởng khoa chuyên khoa. Vũ Nhất Bắc sinh năm 1975 trú thôn Phú Đa, thị trấn Bần Yên Nhân, huyện Mỹ Hào, tỉnh Hưng Yên Cùng về tội" Giả mạo trong công tác" qui định tại điều 284 Bộ luật Hình sự năm 1999 (đã được sửa đổi bổ sung năm 2009).
Và quyết định khởi tố bị can đối với 4 nhân viên Công ty TNHH sản xuất phụ tùng ô tô, xe máy Việt Nam và Công ty Brother gồm: Bùi Văn Long sinh năm 1984 trú tại thôn Đọ, xã Bạch Sam, huyện Mỹ Hào, HƯng Yên; Trần Thị Quỳnh sinh năm 1978 trú thôn Phú Đa , thị trấn Bần Yên Nhân, huyện Mỹ Hào, tỉnh Hưng Yên; Trương Văn Chuẩn sinh năm 1981 trú tại đội 10, thị trấn Như Quỳnh, huyện Văn Lâm, Hưng Yên, cả ba đối tượng trên là nhân viên của Công ty TNHH sản xuất phụ tùng ô tô, xe máy Việt Nam và Bùi Thị Hiền sinh năm 1987 thôn Vân An, xã Minh Đức, huyện Mỹ Hào, tỉnh Hưng Yên nhân viên Công ty công nghiệp Brother Việt Nam. Cùng về tội "làm giả tài liệu cơ quan tổ chức qui định tại điều 267 Bộ luật hình sự năm 1999 (đã sửa đổi bổ sung năm 2009).
Sau thời gian đấu tranh, tính đến nay Cơ quan Cảnh sát điều tra Công an tỉnh Hưng Yên đã thu hồi được số tiền 321.193.500 đồng.
