Theo đó, ông Phương bị kỷ luật vì có sai phạm trong quá trình chỉ đạo và tổ chức thực hiện các hạng mục thuộc dự án ứng dụng công nghệ thông tin từ năm 2012 - 2013.
Cụ thể, ông Phương với tư cách là chủ đầu tư dự án khi ký hợp đồng với Công ty CP tin học giải pháp tích hợp mở (TP.HCM) thực hiện kế hoạch đào tạo tin học cho cán bộ, công chức, viên chức ở Phú Yên; chuyển giao công nghệ phần mềm quản lý văn bản cho Trung tâm tích hợp dữ liệu và Trung tâm công nghệ thông tin (Sở TT-TT tỉnh Phú Yên).
Quá trình thực hiện, ông Phương cùng một số cán bộ thuộc cấp đã cố ý làm trái nguyên tắc tài chính gây thất thoát hơn 1 tỉ đồng, lãng phí tài sản nhà nước hơn 320 triệu đồng. Vụ việc đã được Cơ quan CSĐT Công an tỉnh Phú Yên khởi tố vụ án, khởi tố bị can đối với ông Lê Tiến Dĩnh (nguyên Giám đốc Trung tâm tích hợp dữ liệu Phú Yên) và bà Nguyễn Thị Hiếu (nguyên phụ trách kế toán của trung tâm này) về tội cố ý làm trái quy định của nhà nước về quản lý kinh tế gây hậu quả nghiêm trọng.
Ông Phương cũng đã bị Ban Bí thư T.Ư Đảng kỷ luật cách chức các chức vụ trong Đảng như: Tỉnh ủy viên, Bí thư Đảng ủy Sở TT-TT Phú Yên. Ủy ban Kiểm tra Tỉnh ủy Phú Yên cũng đã chuyển hồ sơ sai phạm của ông Phương sang Cơ quan CSĐT Công an Phú Yên để điều tra, làm rõ.
Theo Thanh niên