Trong vụ quán Xin Chào, đại tá Quý là người ký quyết định khởi tố bị can và kết luận điều tra đối với ông Nguyễn Văn Tấn (49 tuổi, chủ quán) về hành vi Kinh doanh trái phép.
Các quyết định này của ông Quý, sau đó, được các cơ quan chức năng xác định là "không đúng quy định".
Ngoài ra, liên quan tới vụ việc này, hai phó Đội cảnh sát kinh tế và chức vụ của Công an huyện Bình Chánh cũng bị kỷ luật. Cụ thể, thiếu tá Nguyễn Hoàng Tuân bị cách chức, đại úy Lê Cảnh Tuân bị cảnh cáo.
Trước đó, ngày 13/8, Viện Kiểm sát Nhân dân Tối cao đã kỷ luật cách chức ông Lê Thanh Tòng, Phó Viện trưởng Viện Kiểm sát nhân dân quận 6 (nguyên Phó Viện trưởng Viện Kiểm sát nhân dân huyện Bình Chánh) và ông Huỳnh Văn Son, Kiểm sát viên sơ cấp Viện Kiểm sát nhân dân huyện Bình Chánh cũng vì tham gia khởi tố chủ quán Xin Chào.
Diễn biến vụ việc như sau, ngày 18/8/2015, ông Tấn bị Công an huyện Bình Chánh ra quyết định xử phạt do bán cà phê giải khát, ăn sáng... khi chưa được cấp giấy chứng nhận đăng ký kinh doanh.
Tháng sau, công an lại kiểm tra quán, cho rằng ông Tấn kinh doanh khi chưa được cấp giấy chứng nhận đủ điều kiện vệ sinh an toàn thực phẩm. Ông Tấn sau đó bị khởi tố về hành vi Kinh doanh trái phép.
Khi vụ án sắp được đưa ra xét xử, lần lượt Thủ tướng Nguyễn Xuân Phúc chỉ đạo TP HCM kiểm tra lại việc xử lý hình sự ông Tấn, Bí thư Thành ủy TP HCM Đinh La Thăng yêu cầu Công an và VKSND TP HCM rà soát vụ việc.
Trong cuộc họp báo sau đó, Công an TP HCM xác định xử lý hình sự ông Tấn là "có căn cứ nhưng nóng vội". Cùng thời điểm, TAND huyện Bình Chánh trả hồ sơ vụ án để điều tra bổ sung.
Ngày 23/4, Viện trưởng VKSND Tối cao Lê Minh Trí làm việc với lãnh đạo VKSND TP HCM và huyện Bình Chánh, yêu cầu các đơn vị này đình chỉ vụ án, đình chỉ bị can, xin lỗi và bồi thường cho ông Tấn. Nhận quyết định vô tội, ông Tấn từ chối được bồi thường, chỉ mong muốn được yên ổn làm ăn.
Ngay sau đó, Ban giám đốc Công an TP HCM tạm đình chỉ công tác đối đại tá Quý và thiếu tá Nguyễn Hoàng Tuấn (Phó đội CSĐT Kinh tế và Chức vụ - Công an huyện Bình Chánh) để làm rõ những sai phạm, nhằm xử lý.