Theo Bảo hiểm xã hội thành phố Hà Nội, quỹ bảo hiểm y tế của thành phố đang vượt chi khoảng 1%. Thời gian tới, Bảo hiểm xã hội thành phố sẽ phối hợp với Sở Y tế Hà Nội xây dựng kế hoạch thanh tra khoảng 50 cơ sở y tế có bội chi quỹ khám chữa bệnh bảo hiểm y tế trong 9 tháng đầu năm 2016.
Nội dung kiểm tra nhằm xác định nguyên nhân đối với các cơ sở y tế có chi phí khám chữa bệnh bảo hiểm y tế bất thường, tần suất bệnh nhân khám chữa bệnh tăng, việc chỉ định sử dụng thuốc, chỉ định cận lâm sàng, chỉ định bệnh nhân vào nội trú và kiểm tra phác đồ điều trị của các cơ sở y tế.
Theo Bảo hiểm xã hội Hà Nội, trong 6 tháng đầu năm 2016, Hà Nội không bội chi quỹ bảo hiểm y tế. Tuy nhiên, đến đầu tháng 10, số chi đã lên tới 98% quỹ bảo hiểm y tế.