Theo Bộ Giao thông vận tải, những hợp đồng BOT (xây dựng - kinh doanh - chuyển giao) mà Bộ Kế hoạch và Đầu tư tiến hành thanh tra, ngay sau khi có dự thảo và kết luận thanh tra, Bộ đều có văn bản giải trình và báo cáo Thủ tướng Chính phủ.